Rekaman menunjukkan beliau tiba-tiba kehilangan kesadaran di atas mimbar, sontak menjadi perhatian para jamaah yang langsung berusaha memberikan pertolongan.
Setelah insiden tersebut, KH. Muhammad Nasir segera dibawa ke RS St. Antonius untuk mendapat perawatan dan pengecekan. Namun sayang, nyawanya tidak tertolong dan beliau dinyatakan meninggal dunia pada pukul 14.05 WIB.
Berita wafatnya KH. Muhammad Nasir mengejutkan banyak pihak, terutama masyarakat Sei. Jawi dan jamaah Masjid Jihadul Muslimin, tempat beliau bertugas selama bertahun-tahun (R-69).
